Lunes 30 de agosto, 2010

Los 20 aminoácidos independientemente cada uno tiene una abreviatura de tres letras las cuales se usan para algún texto, formato, etc. Con el fin de no repetir muchas veces con su nombre largo y usar ejemplo Ala. En sus abreviaturas de dos se usan para secuencias por ejemplo este compuesto contiene A, A, N, y D.

Aminoácidos	P/texto	P/ Sec.
Alanina Arganina Asparagina Ácido Aspártico Cisteína Acido Glutáminico Glutamína Glicina Histidina Isoleucina Leucina Lisina Metionina Fililalanina Prolina Serina Treonína Triptófano Tirosína Valina	Ala Arg Asn Asp Cys Glu Gln Gly His Ile Leu Lys Met Phe Pro Ser Thr Trp Typ Val	A R N D C E Q G H I L K M F P S T W Y V

CURVA DE TITULACIÓN.

Se conoce a la curva de titulación a la que aparece en una grafica. Usamos como ejemplo la Alanina. El pH se puede volver zwitterión.

Hay un punto 100% catiónico, al que si se le añade sustancia ácida su pH ↓.

En la grafica se encuentra un punto isoelectrico (p.I) donde todas las moleculas del aminoacido se encuentran en forma zwitterion (100%zwitterion).

El punto pK1, también se conoce como ácido. aparece cuando se encuentra en la grafica se localiza un 50% cationico y un 50% ztwitterion. Es el punto de ionizacion.

Como hay un pK1 (ácido) también habra un pK2 o basico donde la mitad es 50% anionico y el otro 50% zwitterion. Y el [H⁺] es el que interviene en todo momento.

Se aclara que no es la misma curva para los otros aminoacios, cada uno tiene una diferente.

esta imagen es un ejemplo, la curva que aparece es la curva de titulación.

Un ejemplo mas claro seria el que se uso en clase, se tiene 10 casas en renta, cada una tiene dos cuartos, en una temporada todas las casas estan ocupadas y los cuartos de igualmenera. Eso seria 100% cationico.

Empieza la temporada de clases, los turistas regresan a casita y se quedan de las 10 casas 5 ocupadas con sus dos cuarto y de las otras 5 solo tienen ocupado un cuarto. Esta en pK1.

Siguen regresando por que ya casi terminan la vacaciones y las 5 casas que estaban ocupadas en su totalidad se quedan igual que las otras 5 solo un cuarto ocupado. Es p.I. (punto isoelectrico).

Luego estan en la primera semana de agosto y el inicio de clases es el 9, 5 casas de las 10 que estaban con solo un cuarto ocupado se quedan solas, es decir, que 5 casas estas libres y 5 solo tiene un cuarto ocupado cada una. Es pK2.

Y por ultimo llego el inicio de clases todos los turistas se regresaron y las casas, las 10, no tiene ni un cuarto en renta este es 100% anionico.

Patricia Reyes

Viernes 27 de agosto, 2010

Formas iónicas.

Las formas iónicas pueden ser diferentes en su estructura debido a que unas tienen o requieren mas hidrógenos (basicas) y las otras no requieren de menos (acida), pero siempre será el mismo aminoácido.

A estas formas básicas se clasifican en 2 grupos:

Amino: que siempre requiere hidrógeno.

Carboxilo: este rechaza a los hidrógenos.

Cuando en el grupo carboxilo llega un hidrogeno (H) inmediatamente este lo rechaza mientras que el grupo amino requiere de estos hidrógenos y los absorbe. Pero cuando estos se encuentran en un mismo nivel o mismo ambiente de le denomina Anfótera,quiere decir que las moléculas tienen la capacidad de dar protones.

También se describen los Cationes (que son de carga positiva) y los Aniones (de carga negativa) aquí entre mas hidrógenos existan la carga será mas positiva.

Entonces cuando exista un pH 1 se le denomina catiónica, cuando es un pH 12 es Aniónica y cuando los dos están en un mismo ambiente cada uno recibiendo lo que necesita o bien, existe una mezcla entre los dos se le llama Zwitterion (hibrido) .

Todo esto dependerá de pH que exista en el ambiente, ejemplo:

Dayan Alvarez

Jueves 26 de agosto, 2010

Miercoles 25 de agosto, 2010

Iniciamos hablando de proteínas que al final de cuenta es con lo que trabajaremos a lo largo del semestre. Llegamos al punto de que estamos compuestos por 4 grupos.

Son los siguientes:

Carbohidratos.

Proteínas.

Acido nucleico.

Lípidos.

Las proteínas están formadas por biomoléculas, pero que son las biomoléculas?

Son moléculas que van a formar un ser vivo y para tener moléculas necesitamos crearlas nosotros, es decir, como un circulo vicioso, las moléculas crean al ser vivo y nosotros a las moléculas. Las moléculas están formadas por hidrogeno, oxigeno, nitrógeno y carbono estos son los mas esenciales pero también esta constituido en pequeñas porciones de otro como el K, Na, Ca, P, S, Mg, etc.

Las proteínas son polímeros y son la unión de moléculas pequeñas formando una moléculas grandes, también se conoce como una cadena larga de monómeros. Los monómeros forman los aminoácidos y los aminoácidos a las proteínas.

Un aminoácido es una molécula formada por un amino, un carboxilo, hidrogeno un radical y el carbono.

Para medir la cantidad de hidrogeno usamos la unidad de pH, al ver la variación de iones sabremos si esta acido o base.

pH=↓ Acido y sus iones niveles de hidrógenos son altos. Además de aceptar H.

pH=↑ Base y sus iones niveles de hidrógenos son bajos. Aquí suelta H.

Los aminoácidos son extremadamente complejos. Podemos encontrarlo como:

L− catiónica

L−anionica

L−zwitterion (híbridos)

Lo mismo con la D−

D− catiónica

D− anionica

D− zwitterion (híbridos).

En la condensación un aminoácido por enlace peptídico son separados por una encima rompiéndolo y separándolo entre –OH dejándole un enlace disponible. De ambos lados en el otro aminoácido rompe donde esta –H.

En la hidrólisis es todo lo contrario a la condensación por que aquí lo que intenta hacer la encima es romper l enlace peptídico para luego meter el O-H-H y regresarlos a su estado aminoácido solo.

Patricia Reyes

Lunes 23 de agosto, 2010

El día de hoy terminamos con el tema de termodinámica, y para finalizar vimos los dos últimos conceptos aplicados en la termodinámica. El primer concepto fue la entalpia, así se le llama a la cantidad de calor que tiene un cuerpo. (Calor lo podemos representar como “Q”). Nos es más fácil hablar de entalpia que de entropía, ya que la entropía es más difícil de medir, en comparación con la entalpia que nos permite medir más fácil, el calor que se encuentra en los cuerpos, también da las características sobre lo que está hecho.

Dependiendo de la cantidad de entalpia podemos obtener diferentes reacciones. La primera reacción es la reacción endotérmica, que es cuando tiene o recibe más calor una reacción química. La segunda reacción es la reacción exotérmica, aquí la reacción empieza con cierto nivel de calor, pero este disminuye. Pierde o libera calor, se representa mejor cuando una reacción se calienta y se puede percibir.

El segundo concepto es la energía libre, esta es la energía disponible para realizar un trabajo. (Energía se representa como “G”). Cada objeto contiene su energía libre, pero no todos pueden realizar un trabajo, por lo que esta energía libre los ayuda a realizarlo.

En la energía libre también encontramos dos tipos de reacciones: la primera reacción es la reacción endergónica, aquí la energía libre del sistema aumenta. En esta reacción cuando la energía se toma de algún lado (universo) perdemos energía. La segunda reacción, es la reacción exergónica, que es cuando la energía libre disminuye en una reacción, libera energía de algún tipo.

Debemos de saber que la entropía, la entalpia y la energía libre son formas o unidades en las que se encuentra el calor en un cuerpo.

Maria Silva

Jueves 19 de agosto, 2010

Buenas tardes compañeros el dia de hoy 19 de agostos del 2010 continuamos viendo el tema de , isomeros hicmos unos ejercicios mas para que nos quedara mas claro en quese diferencian , para poder asi dominarlos ya que los estaremos manejando durante el semestre.

Empezamos con el tema de TERMODINAMICA, pensamos que si dividiamos la palabra mas o menos obtendriamos que

es Calor/Actividad. Hay que tener en claro que calor no es lo mismo que temperatura el calor es una forma en la que viaja la energia y en

la que se tranfiere y la temperatura es una unidad del movimiento y te indica cuando se esta moviendo una particula. El calor tiene que ver

con cuanta friccion estan causando estas particulas, mientras mas friccion la temperatura va a hacer mas alta. Estudiamos lo que son los

PRINCIPIOS DE LA TERMODINAMICA

• El 1er principio: Tiene que ver con la Ley de la conservacion de la masa que nos dice "La materia no se crea ni se destruye solo se transforma" y con la La Ley de la conservacion de la energia que nos dice tambien "La energia no se crea ni se destruye solo se trasnforma". Entonces esto dio a deducir que estas dos propiedades tenian algo en comun que las hacia tener la caracteristica de la ley y resulto esta

E= mc2 Donde E= energia m=masa c2=velocidad de la luz al cuadrado.

• El 2do principio: Habla sobre la Entropia que en esta clae solamente vimos que es lo que mide el desorden de la materia, pero la retomaremos el dia de mañana.
• El 3er principio: Estudia las temperaturas tan bajas, pero tan baja, pero tan bajas, super bajas, bajisiiiiisiiimas, que no se puede alcanzar como el 0 absoluto (se destruiria el universo .

• El 4to principio : Que se conoce como "Princio Cero" nos explica el equilibrio y la direccion del calor, por ejemplo ,si 2 sustancias en contacto se encuentran a diferente temperatura, una de ellas emitirá más calor y calentará a la más fría. El equilibrio térmico se alcanza cuando ambas emiten, y reciben la misma cantidad de calor, lo que iguala su temperatura.

Esto es todo por mi parte el dia de mañana compañeros continuaremos con el tema de ENTROPIA no lo olviden.

Monica Martinez

Miercoles 18 de agosto, 2010

al comenzar la clase revisamos lo que vimos la clase anterior , que fue la definicion de isomero, un enantiomero y un diasteroisomero,

tambien los isomeros geometricos que se dividen en 2 tipos "cis y trans"

esos tipos de isomeros siempre tiene una doble ligadura

y que los cis su radical se encuentra en la misma posicion hacia la parte superior de la linea imaginaria horizontal.

vimos tambien que era un estereoisomero y como esta estructurado un enantiomero y su carbono quiral.(1)

diasteroisomero su forma estructural y tiene 2 o mas carbonos quirales (2)

la diferencia enantiomero y un diasteroisomero es 1 de los carbonos quirales se invierte.

en clase

existen diferentes clasificaciones para los enantiomeros

enantiomero

el sistema L D

- +

S R

esta clasificacion permite si la luz gira hacia la izquierda y se vuelve L - ALANINA

por el contrario si la luz gira hacia la derecha se vuelve D + ALANINA

L: EVOGIRA

D: EXTROGIRA

EN LA MAYORIA DE LOS AMINOACIDOS DEL SER HUMANO ENCONTRAMOS L- ALANINA.

S: INISTER

R: ICTUS

PARA SABER SI UN ENANTIOMERO ES S O R TENEMOS QUE ENUMERAR EN PRIORIDAD C(1) OH(2) CH3(3) CL(4) DEPENDIENDO EN LA POSICION EN QUE SE ENCUENTREN LOS NUMEROS ES COMO SE VA A DISTINGUIR SI ES S O R. CUANDO LAS FLECHAS SE ENCUENTRAN EN SENTIDO CONTRARIO DE LAS MANECILLAS DEL RELOJ ES S Y CUANDO GIRAN DEL MISMO LADO DE LAS MANECILLAS DEL RELOJ ES R.

LA DIFERENCIA CUANDO EN ENANTIOMERO Y DIASTEROISOMERO.

Rocio Acero

Lunes 16 de agosto, 2010

ENANTIOMEROS Y DIASTEROISOMEROS

Isomeros: Los isómeros son compuestos que tienen la misma composición atómica pero diferente fórmula estructural.

* Isomero Geométrico
* Isomero Esteroisomero

Formula condensada: C4H10
Formula desarrollada: H H H H

H-C-C-C-C-H

H H H H

* Isomeros geometricos:
Esta es debida a que no se puede realizar la rotación de un enlace carbono-carbono ya que hay presencia de dobles enlaces. Hay dos tipos de isomeros geométricos: CIS Y TRANS

Se llaman cis a los isómeros que tienen los grupos al mismo lado y trans los que lo tienen a lados opuestos.
Los trans se vuelven perjudiciales para las personas

Ejemplo: CIS TRANS

* Esteroisomeros:

Son los que tienen quiralidad en su molécula.

Hay dos tipos de estereoisomeros: Enantiomeros y Diasteroisomeros

- ENANTIOMEROS
Son moléculas especulares, que no son superponibles de si mismo. Son moléculas quirales, solo ocupan de un carbono quiral

- QUIRAL: Quiere decir que ninguno de sus cuatro enlaces tiene un mismo elemento

- DIASTEROISOMERO: Se ocupan dos carbonos quirales. No son superponibles pero tampoco imagen especular uno del otro

Marissa Morfin

Viernes 13 de agosto, 2010

Jueves 12 de agosto, 2010

El día de hoy hicimos varias cosas en clase. Primero, el profe nos hablo de los correos cadenas y nos conto las historia del que le gustaba más. La historia era de una familia perfecta que tenía un hijo de diez años. Ellos tenían todo organizado, nomas comían comidas orgánicas, y tenían todo calculado. Un día se enfermo el niño de gripe. Los padres le dieron medicina, pero nada no se curaba. Así que decidieron llevarlo a diferentes doctores pero no nadie le podía quitar la gripe. Un día un doctor sentó a los padres y les pregunto que si alguno de ellos había engañado al otro, pero como eran perfectos no había sucedido. Así que les dijo que él pensaba que el niño tenía sida. Se hicieron las pruebas de sida y los padres eran negativos, pero el niño salió positivo. Así que los padres se pusieron a pensar que es lo que había estado fuera de lo normal en las últimas semanas. Llegaron a la conclusión que lo único fuera de lo normal era que el niño había comido Carls Jr. en las semanas pasadas. Como cualquier padre preocupado ellos fueron al Carls Jr. a investigar que pudo haber pasado. Ahí encontraron que un trabajador tenía sida y que hace unas semanas se había cortado y no se dio cuenta. Y ahí empezaba lo que te decía que no fueras al Carls Jr. Al principio nos pregunto el profe que quien pensaba que si podía pasar esto y yo levante la mano. Después empezamos lo que ya sabíamos. Así llegamos a la conclusión que no podía pasar por estas razones:

1) 1) La historia dice que se contagio de sida y el sida no es contagioso lo que es contagioso es el HIV

2) 2) El niño tenía que tener una cortada para que haga contacto sangre con sangre

3) 3) Es muy poquito tiempo para que se desarrolle el virus

4) 4) La temperatura tenían que estar igual al del cuerpo y la carne caliente lo desasiera

5) 5) El virus sobrevive en la sangre así que el cuarto donde salió la sangre debería de tener el mismo pH que la sangre para que pudiera sobrevivir

Después que terminamos con eso seguimos con una actividad donde tenías que definir que es vida. El profe nos dividió en equipos de tres donde teníamos que pensar en razones porque o porque no estaba vivo un tiburón una camisa y un virus. Mi equipo llego a la conclusión que el tiburón está vivo pero la camisa y el virus no, no estábamos muy seguros de cómo explicarlo. Después de eso nos acomodamos en tres grupos más grandes y a cada uno le tocaba una de las cosas y tenían que llegar a entender porque si o porque no estaba vivo. Lo difícil es que no podíamos hablar, o escribir las razones en el pizarrón. El primer equipo le toco el tiburón. Ellos dibujaron en el pizarrón sus razones que eran que comía, se reproducía, respiraba, reaccionaba, tenia células, y se movía. Después seguía mi equipo que nos toco la camisa. Nosotros nos pusimos en una línea y mi compañero nos movía y hico la línea más compacta. Con eso queríamos decir que la camisa no está viva por que la hico el hombre. El último equipo les toco el virus. Ellos actuaron que se contagiaba y así se reproducía y después se moría. Ya que acabamos llegamos a la conclusión que para saber si algo está vivo tiene que tener ciertas cosas:

1) Células

2) La habilidad de reaccionar

3) Ciclo de vida

4) Metabolismo

5) Organización

6) CHON

7) Ácidos nucleídos

Natalia Gonzalez

Lunes 9 de agosto, 2010

La clase de hoy comenzó con el temario, el profesor nos pidió que lo leyéramos muy bien, a continuación el profesor nos empezó a explicar el primer punto del temario el cual era el horario no hubo la necesidad de que explicara mucho por que nosotros ya teníamos el horario claro. Y nos dijo que en su clase no nos quería estresados, que nos relajáramos.

Enseguida se paso a explicar la evaluación, nos explico que el 80% de nuestra calificación era de teoría la cual va a ser evaluada por el, también nos explico en que consistía punto por punto. Nos dijo que el numero de exámenes parciales podría variar entre 2 a 4 y esto dependería de lo que el considerara mejor.nos dijo que si entregábamos las tareas puntuales iba a tener un valor de 10%.

Nos explico que después de cada clase se deberá hacer un resumen el cual lo tenemos que enviar a su correo y esto tendría el valor del 15% de la calificación parcial, pero nos dijo que tenia un limite de tiempo para entregarlo y una tolerancia por si no pudieron entregarlo a tiempo pero que su valor seria el 50% de su valor original nos dijo que solo había tres calificaciones posibles que eran 100 que es cuando esta completo, 50 cuando estuvo breve o con faltas de ortografía y 0 cuando de plano esta súper mal. De estos resúmenes el va a subir a blogspot el mejor de cada día y la persona que tenga mejores resúmenes tendrá la oportunidad de ganarse un 10% extra de su calificación en el parcial. A nuestra participación en clase le dio un valor del 5% de nuestra calificación.

Nos dijo que tenía reglas para poder entrar al salón después de haber comenzado la clase, el que quisiera entrar deberá contar un chiste pero no pondrá asistencia.

Después de todo esto nos dijo que el otro 20% de nuestra calificación total seria de prácticas pero iba ser evaluada por la docente que nos impartiera el curso.

Nos explico lo que debería llevar cada trabajo y que deberá ser entregado por vía electrónica ya que a el no le gusta gastar papel. Y una nota muy importante que nos menciono fue que el trabajo seria anulado si ocurriera un plagio ya que no quería trabajos iguales entre compañeros, otras notas importantes fueron; que para aprobar el curso se deberá tener por lo menos 60 de calificación y cumplir con el 80% de asistencia.

Aracely Silva

BIENVENIDOS

Este será su blog por este semestre, espero que les sea útil.

Viernes 16 de abril del 2010

El día 16 de abril en la clase de bioquímica, tratamos el tema de:

ISOPRENOIDES:

Se originan por polimerización enzimática de dos o más unidades de isopreno, ensambladas y modificadas de muchas maneras diferentes. Este se puede llegar a inducir a polimerizarse en múltiplos de 5 carbonos, generando numerosos anillos de terpenos.

Son muy abundantes entre los vegetales, formando parte de los aceites esenciales de las plantas, a las que dan su olor característico, como el geraniol del geranio, el limoneno del limón, o el mentol de la menta.

Este grupo de moléculas de repeticiones de estructuras se hace llamar: UNIDAD DE ISOPRENO.

La lógica nos dice que con una sola unidad, solo la repites, pero con estos tienes 1 molécula que se llama:ISOPENTENILPIROFOSFATO y por medio de este se obtienen los Isoprenoides.

Algo que se mencionó fue que el Acetil CoA tiene la función de “romper” con los fosfatos y separarlos ya sea para que sean re-utilizados para el ATP o alguna otra sustancia que solicite los fosfatos, mientras que la estructura que queda en el espacio se viene a convertir en Isopentano, que con algunas modificaciones o acomodos que se puedan hacer en dichos componentes puede llegar a convertirse nuevamente en un Isopreno*.

* A temperatura ambiente el isopreno es un líquido incoloro altamente inflamable y de fácil efecto. En contacto con el aire es altamente reactivo, capaz de polimerizarse de forma explosiva si se calienta. En algunos países como Estados Unidos el Departamento de Transporte considera el isopreno un material peligroso que necesita de marcas especiales.

Aquí debemos de tomar en cuenta que hay 2 tipos de Isoprenoides:

1. Terpenos
2. Esteroides

TERPENOS:

El nombre proviene de: que los primeros miembros de esta clase fueron derivados del aguarrás ("turpentine" en inglés, "terpentin" en alemán).

Pueden ser lineales, ciclados o ambos.

Generalmente son hidrocarburos ramificados e insaturados.

Son una diversa clase de compuestos orgánicos que se derivan del isopreno y se originan por polimerización enzimática de dos o más unidades de isopreno, ensambladas y modificadas de muchas maneras diferentes.

Estos se clasifican de acuerdo al número de repeticiones de Isopreno que tengan, por ejemplo:

Los monoterpenos Están presentes, por ejemplo, en las esencias del eucalipto, los sabores del clavo y el jengibre. También en el citral, mentol, alcanfor. Juegan un rol importante en la medicina tradicional y en los remedios herbolarios, y se están investigando sus posibles efectos antibacterianos y otros usos farmacéuticos.

Los serquiterpenos así como los monoterpenoides, muchos sesquiterpenoides están presentes en los aceites esenciales. Además muchos sesquiterpenoides actúan como fitoalexinas, compuestos antibióticos producidos por las plantas en respuesta a la aparición de microbios, y como inhibidores de la alimentación ("antifeedant") de los herbívoros oportunistas.

Los triterpenos existen diferentes mecanismos de ciclación y directamente relacionados con ellos se encuentran los esteroides, las hormonas.

Los tetraterpenos en este grupo son abundantes las xantofilas*1 y carotenos*2, (que son pigmentos vegetales amarillo y anaranjado respectivamente). Dan color a los frutos, raíces (zanahoria) flores etc.

En la fotosíntesis desempeñan un papel clave absorbiendo energía luminosa de longitudes de onda distinta a las que capta la clorofila. El caroteno es precursor de la vitamina A.

*1 Para conseguir las Xantofilas simplemente al Caroteno le agregas oxígeno.

*2Para conseguir el caroteno simplemente agregas al Carotenoide una cadena de Hidrocarburo y consigues el Caroteno.

Ejemplo de cómo quedaría cada uno:

Hay moléculas que son mezclas como los Terpenos más otra molécula que no tiene nada que ver con los Terpenos y a estos se les llamará: TERPENOS MIXTOS.

ESTEROIDES:

Son terpenos que tienen Carbonos fusionados en forma de anillo y todos provienen del Escualeno.

La diferencia que tienen es el doble enlace que tienen en la posición y de los radicales en el Carbono 17.

El colesterol es el más importante de los esteroides. Son importantes en el ser humano porque son hormonas.

ESTEROLES:

Son un grupo de esteroles, que son moléculas orgánicas que forman parte de la membrana de las células vegetales, con una función similar a la del colesterol en las membranas celulares animales. Los esteroles vegetales se encuentran en pequeñas cantidades en aceites vegetales. Un complejo de estos se ha comercializado como complemento dietético para reducir la absorción de colesterol ingerido en las dietas de personas con hipercolesterolemia.

Como grupo de esteroles tenemos a los GLUCOSIDOS CARDIACOS, estos son tóxicos en algunas plantas, ya que lo usan como mecanismo de defensa con otros animales para evitar ser devorados, como por ejemplo; la hiedra venenosa.

Hay otros sucesos por ejemplo en el que se utilizan ampliamente en las medicinas, como en los tratamientos de la insuficiencia cardíaca. Tenemos los digitálicos que estos estimulan al músculo cardíaco. En el caso específico de los digitálicos se le llama Digitoxina que este alcaloide ejerce una acción hipotensora sobre el corazón y los vasos, haciendo su pulso más lento y aumentando la cantidad de sangre expulsada por el propio corazón.

Un ejemplo de esta Digitoxina sería:

Yolanda García